Mit den beiden letzten Missae breves, der Missa Sancti Nicolai und der Missa Sancti Joannis de Deo, hat Haydn Meisterwerke geschaffen, die bereits zu seinen Lebzeiten zu den beliebtesten dieser Gattung zählten. Die "Kleine Orgelsolomesse" ist trotz der Textschichtungen im Gloria und Credo nie mit dem Vorwurf der Unkirchlichkeit bedacht worden, wird doch der Text auch bei der ungewöhnlichen Kürze des Gloria (31 Takte) differenziert gestaltet. Eine große Stärke der Komposition liegt im den Hörer geradezu magisch fesselnden Ausdruck. Die Partitur enthält zugleich die Orgelstimme.